Exercice cours Structure des proteines

Bonjour je comprend cette exercice a moitié je voulais savoir si il était possible que vous l'expliquiez ,pour comprendre comment on trouve la séquence oligosidique



Merci de votre réponse

hello !

On te dit que la dégradation Edman donne la phénylalanine en 1. Donc ici c'est facile, c'est le premier AA sur la liste. On obtient :
1      2      3       4      5       6      7
Phe   ?       ?      ?       ?       ?      ?

Ensuite on te dit que la chymotrypsine donne 1 AA libre, 1 dipeptide (2 AA) et 1 tétrapeptide (4 AA). Là ou je met le "/" c'est là ou la chymotrypsine va venir couper.
1   /   2      3    /   4      5       6      7
Phe  / ?      ?   /     ?       ?       ?      ?

On a bien notre AA seul qui est Phe, suivi de 2 AA, suivi de 4 AA. On sait aussi que la chymotrypsine coupe après Phe ou Tyr ou Try. Donc avant la cassure "/" il doit obligatoirement y avoir un de ces AA. Le seul AA restant parmi c'est trois là est Tyr, on obtient donc :
1     /   2      3    /   4      5       6      7
Phe  /  ?    Tyr    /    ?       ?       ?      ?

Le bromure donne 1 tétrapeptide, 1 dipeptide et une lysine. Le "/" représente là où le bromure va couper :
1      2      3      4  /    5       6  /    7
Phe   ?     Tyr     ?  /     ?       ?  /   ?

De plus on sait qu'il coupe après une méthionine donc :
1      2      3      4     /    5       6    /    7
Phe   ?     Tyr   Met   /    ?      Met  /   ?

Et on sait qu'à la fin il libère 1 lysine donc :
1      2      3      4     /    5       6    /    7
Phe   ?     Tyr   Met   /    ?      Met  /   Lys

Ensuite il faut se rappeler que la chymotrypsine a donné un tétrapeptide (correspondant aux numéros 4, 5, 6 et 7) et que dans ce tétrapeptide il y a : Leu, Lys, Met et Met. On a déjà placer 1 Met en 4, 1 Met en 6 et 1 Lys en 7. Donc forcement on va mettre Leu en 5.
1      2      3      4     /    5       6    /    7
Phe   ?     Tyr   Met   /    Leu      Met  /   Lys

Il ne nous reste plus que Asp à placer en 2 et c'est tout bon !!

C'est très très clair maintenant , merci beaucoup de ta réponse.