déchiffrage annotation du génome
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déchiffrage annotation du génome
Bonsoir,
Dans le cours sur l'organisation du génome humain, le prof explique comment identifier les gènes codants (voici la partie du cours) :
b) Déchiffrage, annotation du génome : Bioinformatique
Ex. : Comment identifier des gènes codants (parmi un message monotone de A, T, C et G)
1 Détection des cadres ouverts de lecture, ORF (Open Reading Frame) :
- tester informatiquement les 6 cadres de lectures d’un ADNdb
- utilisation du code génétique (1 codon [= 3 nt.] = 1 A.A ou STOP) - utilisation des séquences « consensus » (ex. début de traduction = ATG) - retirer informatiquement les introns (début intron GT, fin AG...)...
2 Preuve directe à partir des ADNc (complémentaire) :
- analyse de l’expression des ARNm (banque d’ADNc par des transcriptases inverses) grâce à la RT-PCR (Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction)
- les ADNc examinés correspondent à des ARN transcrits et maturés (perte des introns) [/font][/i]
Je n'ai pas bien compris cette partie et notamment celle sur les ADN complémentaires, en quoi ils nous permettent d'avoir une "preuve directe", et qu'est ce que la preuve directe ?
Merci d'avance et désolée, la question est hyper générale haha...
Dans le cours sur l'organisation du génome humain, le prof explique comment identifier les gènes codants (voici la partie du cours) :
b) Déchiffrage, annotation du génome : Bioinformatique
Ex. : Comment identifier des gènes codants (parmi un message monotone de A, T, C et G)
1 Détection des cadres ouverts de lecture, ORF (Open Reading Frame) :
- tester informatiquement les 6 cadres de lectures d’un ADNdb
- utilisation du code génétique (1 codon [= 3 nt.] = 1 A.A ou STOP) - utilisation des séquences « consensus » (ex. début de traduction = ATG) - retirer informatiquement les introns (début intron GT, fin AG...)...
2 Preuve directe à partir des ADNc (complémentaire) :
- analyse de l’expression des ARNm (banque d’ADNc par des transcriptases inverses) grâce à la RT-PCR (Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction)
- les ADNc examinés correspondent à des ARN transcrits et maturés (perte des introns) [/font][/i]
Je n'ai pas bien compris cette partie et notamment celle sur les ADN complémentaires, en quoi ils nous permettent d'avoir une "preuve directe", et qu'est ce que la preuve directe ?
Merci d'avance et désolée, la question est hyper générale haha...
de la pine- Messages : 41
Date d'inscription : 27/10/2022
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