question 2

Dans cette question, on nous demande de calculer la valeur prédictive négative mais on ne connait pas la prévalence, donc est ce possible de la calculer ?

L’angine infectieuse est en règle générale attribuable à deux causes distinctes : soit virale, soit bactérienne. Seule l’angine
bactérienne nécessite une antibiothérapie.
Afin de pratiquer un bon usage des antibiotiques, et de ne les prescrire que lorsqu’ils sont nécessaires, on souhaite développer un
test de diagnostic rapide (TDR) pour l’angine bactérienne, qui donnerait donc un résultat rapide, en quelques minutes. On s’attend
donc à un résultat positif lorsque l’angine est bactérienne.
Afin d’évaluer les performances diagnostiques du TDR nouvellement développé, on recrute 220 patients souffrant d’angine. On
pratique sur ces patients un TDR, qui est positif pour 135 patients. On utilise comme gold standard un prélèvement
microbiologique, qui met en évidence une bactérie dans 120 cas, dont 111 avaient un TDR positif.
Sauf précision contraire, les intervalles de confiance sont donnés à 95%, et les tests statistiques interprétés au
risque alpha 5%.

Quelle est la valeur prédictive négative du TDR dans cet échantillon ?
Vous ne donnerez que la valeur calculée, sans intervalle de confiance.
Vous donnerez la réponse attendue sous forme d’un pourcentage, c’est-à-dire d’un nombre compris entre 0 et 100, arrondi
au dixième.

Hello,

Pour calculer la VPP il existe 2 formules, VPP = VN / (VN+FN) et la formule du théorème de Bayes au cas où la prévalence n'est pas respectée.
Dans ce cas, étant donné qu'on ne te donne pas la prévalence tu ne peux pas vérifiée si elle est respectée donc tu utilises d'emblée la première formule !
A partir de ton tableau de contingence, tu peux définir le nombre de vrais positifs (+ et + donc ici 111) et de faux positifs (+ et - donc ici 9) :


Tu peux ensuite faire ton calcul, VPP = 111 / 120 = 0,925 soit 93% en arrondissant comme te demandes l'énoncé.

J'espère que c'est plus clair pour toi,
Bon courage