Données censurées
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Données censurées
Bonsoir,
J'ai un peu cherché mais je n'ai pas trouvé de réponse à ma question du coup je la pose ici :
Dans le cours sur l'analyse de survie, on nous précise que les données censurées sont de deux types :
--> Qualitatives : la probabilité de survie données par l'état des sujets : vivant/mort, complications/pas de complications ?
--> Quantitatives : concernent la durée de survie de chaque individu (ici on parle bien du temps de survie (1an, 2ans etc.. ?)
==> Mais je ne comprends pas pourquoi de telles données sont dites censurées ?
Il est écrit qu'une " durée T est censurée si la durée n'est pas totalement observée ", donc dans le cas d'un patient pour qui il n'y a pas d'évènement durant la durée de l'étude on pourra dire que la durée de survie de ce patient est une donnée censurée ?
Mais dans le cas de survenue d'un événement, on aura pu observer intégralement la durée de survie donc dans ce cas elle ne sera plus une donnée censurée ?
==> C'est la même chose pour les données qualitatives, quand il n'y a pas de survenue d'évènements (vivants, pas de complications) on ne parle pas de données censurées si ?
Et donc dans ce cas est-ce que l'on peut dire que l'analyse de survie se base sur l'étude des données censurées ?
==> Les données censurées qualitatives concernent uniquement les exclus vivants ou alors on y ajoute les perdus de vues en estimant que vu qu'on a pas eu de nouvelles, on n'a pas pu observée toute leur durée de survie et donc qu'il y a censure ?
J'espère avoir été clair.
Merci d'avance !
J'ai un peu cherché mais je n'ai pas trouvé de réponse à ma question du coup je la pose ici :
Dans le cours sur l'analyse de survie, on nous précise que les données censurées sont de deux types :
--> Qualitatives : la probabilité de survie données par l'état des sujets : vivant/mort, complications/pas de complications ?
--> Quantitatives : concernent la durée de survie de chaque individu (ici on parle bien du temps de survie (1an, 2ans etc.. ?)
==> Mais je ne comprends pas pourquoi de telles données sont dites censurées ?
Il est écrit qu'une " durée T est censurée si la durée n'est pas totalement observée ", donc dans le cas d'un patient pour qui il n'y a pas d'évènement durant la durée de l'étude on pourra dire que la durée de survie de ce patient est une donnée censurée ?
Mais dans le cas de survenue d'un événement, on aura pu observer intégralement la durée de survie donc dans ce cas elle ne sera plus une donnée censurée ?
==> C'est la même chose pour les données qualitatives, quand il n'y a pas de survenue d'évènements (vivants, pas de complications) on ne parle pas de données censurées si ?
Et donc dans ce cas est-ce que l'on peut dire que l'analyse de survie se base sur l'étude des données censurées ?
==> Les données censurées qualitatives concernent uniquement les exclus vivants ou alors on y ajoute les perdus de vues en estimant que vu qu'on a pas eu de nouvelles, on n'a pas pu observée toute leur durée de survie et donc qu'il y a censure ?
J'espère avoir été clair.
Merci d'avance !
SilvioG.- Messages : 32
Date d'inscription : 06/10/2013
Re: Données censurées
Salut !
Le point clé à bien comprendre, c'est que lors d'une analyse de survie, tu vas analyser un ENSEMBLE de données. Alors certes, pour certains de tes patients, tu pourras observer la survenue de l'événement d'intérêt, ce qui fait que dans ce cas, tu n'auras pas à faire à des données censurées en tant que tel (vu que tu as observé ce qui "t'intéressait" (entre guillemets car ensoit, ce qui t'intéresse, c'est qu'il n'y ait aucun événements "décès" vu que tu veux par exemple prouver que ton nouveau traitement est efficace)).
Maintenant, il ne faut pas oublier que tu étudie un échantillon entier, dans lequel certains patients seront perdus de vues/ exclus vivants. Etant donné que pour ceux à, il n'y a pas eu survenue de l'événement d'intérêt pendant ta période de temps prédéfinie, ces données seront dites censurées.
Le fait que tu puisses avoir une probabilité censure fait que tu as des données censurées.
J'espère avoir répondu à ta question, sinon, n'hésite pas à demander der éclaircissements
Le point clé à bien comprendre, c'est que lors d'une analyse de survie, tu vas analyser un ENSEMBLE de données. Alors certes, pour certains de tes patients, tu pourras observer la survenue de l'événement d'intérêt, ce qui fait que dans ce cas, tu n'auras pas à faire à des données censurées en tant que tel (vu que tu as observé ce qui "t'intéressait" (entre guillemets car ensoit, ce qui t'intéresse, c'est qu'il n'y ait aucun événements "décès" vu que tu veux par exemple prouver que ton nouveau traitement est efficace)).
Maintenant, il ne faut pas oublier que tu étudie un échantillon entier, dans lequel certains patients seront perdus de vues/ exclus vivants. Etant donné que pour ceux à, il n'y a pas eu survenue de l'événement d'intérêt pendant ta période de temps prédéfinie, ces données seront dites censurées.
Le fait que tu puisses avoir une probabilité censure fait que tu as des données censurées.
J'espère avoir répondu à ta question, sinon, n'hésite pas à demander der éclaircissements
Valentin L.- Messages : 15
Date d'inscription : 21/12/2012
Re: Données censurées
Merci ! C'était un peu du chipotage du coup mais j'ai compris dans l'ensemble !
Et je me pose alors la question :
le calcul de la durée moyenne de survie se fait en faisant le rapport entre : (Somme (temps x (évènement+perdus de vues à ce temps)) / somme de tous les évènements + perdus de vues))
Enfin la formule je l'ai un peu faite donc c'est pas très mathématique mais je veux dire que l'on va diviser :
==> la somme des : produits du temps par la somme (évènement + perdus de vues)
==> par la somme des tous les évènements et tous les perdues de vues
Je suis pas très clair dans ce que je dis mais dans le calcul c'est plus évident lol !
Merci d'avance
Et je me pose alors la question :
le calcul de la durée moyenne de survie se fait en faisant le rapport entre : (Somme (temps x (évènement+perdus de vues à ce temps)) / somme de tous les évènements + perdus de vues))
Enfin la formule je l'ai un peu faite donc c'est pas très mathématique mais je veux dire que l'on va diviser :
==> la somme des : produits du temps par la somme (évènement + perdus de vues)
==> par la somme des tous les évènements et tous les perdues de vues
Je suis pas très clair dans ce que je dis mais dans le calcul c'est plus évident lol !
Merci d'avance
SilvioG.- Messages : 32
Date d'inscription : 06/10/2013
Re: Données censurées
Il ne faut pas prendre en compte les perdus de vue car rien ne te dit qu'ils sont morts. La durée moyenne de survie se calcule en faisant :
Ensemble des temps à chaque événement/ Nombre d'événements
Dans l'exemple du cours (1er tableau), tu as 10 événements en tout qui surviennent à différents moment de ton étude (2 à t=2 mois; 3 à t = 6 mois et 5 à respectivement 9, 12, 14, 18 et 20 mois)
Ca donne donc : [(2 x 2) + (3 x 6) + 9 + 12 + 14 + 18 + 20]/ 10 = 9,5 mois de survie moyenne
Ensemble des temps à chaque événement/ Nombre d'événements
Dans l'exemple du cours (1er tableau), tu as 10 événements en tout qui surviennent à différents moment de ton étude (2 à t=2 mois; 3 à t = 6 mois et 5 à respectivement 9, 12, 14, 18 et 20 mois)
Ca donne donc : [(2 x 2) + (3 x 6) + 9 + 12 + 14 + 18 + 20]/ 10 = 9,5 mois de survie moyenne
Valentin L.- Messages : 15
Date d'inscription : 21/12/2012
Re : Données censurées
Merci Valentin !
Mais je te relance du coup parce que lors du dernier cours question/réponses, la question a été posé à Mr Forzy concernant l'inclusion des perdus de vues et donc des données censurées et selon lui je cite : " on s'intéresse également aux censurés, car en effet leur temps de survie existe même si ils sont perdues de vue".
Du coup, on considère tout comme pour chaque évènement que le temps de survie d'un perdu de vue que l'on inclurait dans le calcul du temps de survie moyen correspond à la date à laquelle on l'a perdu de vue ?
Exemple : si on a 3 perdus de vue à t=3 mois et 4 à t=6 mois, on va ajouter :
--> au numérateur de notre calcul : 3 x 3 + 4 x 6
--> au dénominateur : on ajoute 7 individus puisque l'on a 7 perdus de vue en plus de nos événements ??
Merci !
Mais je te relance du coup parce que lors du dernier cours question/réponses, la question a été posé à Mr Forzy concernant l'inclusion des perdus de vues et donc des données censurées et selon lui je cite : " on s'intéresse également aux censurés, car en effet leur temps de survie existe même si ils sont perdues de vue".
Du coup, on considère tout comme pour chaque évènement que le temps de survie d'un perdu de vue que l'on inclurait dans le calcul du temps de survie moyen correspond à la date à laquelle on l'a perdu de vue ?
Exemple : si on a 3 perdus de vue à t=3 mois et 4 à t=6 mois, on va ajouter :
--> au numérateur de notre calcul : 3 x 3 + 4 x 6
--> au dénominateur : on ajoute 7 individus puisque l'on a 7 perdus de vue en plus de nos événements ??
Merci !
SilvioG.- Messages : 32
Date d'inscription : 06/10/2013
Re: Données censurées
Alors je viens de bien voir avec M. Forzy et je t'ai dit des bêtises parce que c'est en fait beaucoup plus compliqué alors attention ERRATUM !
Tu as bien à prendre en compte les perdus de vue étant donné qu'ils ont réussi à survivre un certain temps dans l'étude avant de disparaitre. Je m'appuie encore sur le permier tableau du cours pour pouvoir être plus clair. Grosso modo, il faut multiplier chaque temps de survie par le nombre d'individus présent à ce temps de survie, le tout divisé par l'ensemble des individus qui ont été présent à chaque temps.
Ca donne : (2 x 35) + (6 x 33) + (9 x 30) + (12 x 29) + (14 x 27) + (18 x 26) + (19 x 25) + (20 x 23) + (24 x 22) / (35 + 33 + 30 + 29 + 27 + 26 + 25 + 23 + 22) = 12,78 mois de survie
Ca c'est la méthode simple, mais elle ne prend pas en compte beaucoup de paramètres. Le vrai calcul est beaucoup plus compliqué car on réestime à chaque fois les probabilités de survie aux différents temps en fonction des individus. On ne voit pas ça en P1 mais il veut bien vous faire une "petite" explication en janvier si vous insistez.
En tout cas, il m'a dit que ce type de calcul n'a aucune chance de tomber au concours car trop compliqué, trop long et que vous n'avez pas encore assez de notions en statistiques.
Bon courage !
Tu as bien à prendre en compte les perdus de vue étant donné qu'ils ont réussi à survivre un certain temps dans l'étude avant de disparaitre. Je m'appuie encore sur le permier tableau du cours pour pouvoir être plus clair. Grosso modo, il faut multiplier chaque temps de survie par le nombre d'individus présent à ce temps de survie, le tout divisé par l'ensemble des individus qui ont été présent à chaque temps.
Ca donne : (2 x 35) + (6 x 33) + (9 x 30) + (12 x 29) + (14 x 27) + (18 x 26) + (19 x 25) + (20 x 23) + (24 x 22) / (35 + 33 + 30 + 29 + 27 + 26 + 25 + 23 + 22) = 12,78 mois de survie
Ca c'est la méthode simple, mais elle ne prend pas en compte beaucoup de paramètres. Le vrai calcul est beaucoup plus compliqué car on réestime à chaque fois les probabilités de survie aux différents temps en fonction des individus. On ne voit pas ça en P1 mais il veut bien vous faire une "petite" explication en janvier si vous insistez.
En tout cas, il m'a dit que ce type de calcul n'a aucune chance de tomber au concours car trop compliqué, trop long et que vous n'avez pas encore assez de notions en statistiques.
Bon courage !
Valentin L.- Messages : 15
Date d'inscription : 21/12/2012
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